Учёные выяснили, как получить ДНК высокого качества из морских образцов
<div>
<p>
</p>
</div>
<div>
Океаны всё ещё остаются самой неисследованной частью планеты Земля. И если разнообразие крупных организмов Северного Ледовитого океана во многом можно считать уже установленным, работ, направленных на исследование разнообразия "арктических" микроорганизмов, практически нет. Одна из проблем, помимо труднодоступности, — это получение микробной ДНК высокого качества: при работе с природными образцами часто происходит деградация ДНК, её выделяется очень мало, а секвенированию мешают ингибиторы. <br>
<br>
Методов выделения микробной ДНК на сегодня существует очень много, однако они не приспособлены под работу с морскими образцами. Отсутствие понятной, отработанной методики для этой задачи замедляет исследование морских микроорганизмов — при этом именно с таких исследований может начаться поиск новых генов, отвечающих за синтез антибиотиков или ферментов генетических редакторов. Коллектив учёных из Сколтеха, МГУ имени М. В. Ломоносова и других ведущих научных организаций во главе с руководителем Лаборатории анализа метагеномов <b>Артёмом Исаевым</b> выявил наиболее эффективные наборы для выделения ДНК из разных типов морских образцов и представил результаты в <a target="_blank" href="https://www.nature.com/articles/s41598-023-48804-z#Abs1"><span style="color: #00aeef;">новой работе</span></a> в журнале Scientific Reports. <br>
<br>
Акватории северных морей России долгое время оставались неисследованными.<br>
<br>
<i>"Это труднодоступная зона, но очень разнообразная, поэтому мы сфокусировались именно на Тихом и Северном Ледовитом океанах. Совместно с Центром морских исследований МГУ мы организовали экспедиции и собрали три типа образцов: морские воду и грунт, а также образцы беспозвоночных"</i>, — рассказала первый автор работы <b>Алина Демкина</b>, старший лаборант в Лаборатории анализа метагеномов Сколтеха. <br>
<br>
По словам учёных, несмотря на то что метагеномные исследования активно развиваются, до сих пор не выработано единых критериев и стандартов по работе с морскими образцами. <br>
<br>
<i>"У природных образцов есть свои особенности. Нашей целью было выделить из них ДНК, отсеквенировать её и проверить, какие бактерии там живут. Мы столкнулись с тем, что отработанных методик для выделения ДНК хорошего качества из таких образцов нет. Создавать какой-то протокол с нуля — задача очень долгая, дорогая и трудоёмкая, поэтому мы сфокусировались на готовых коммерческих наборах и проверили, какой из них может давать результат наилучшего качества для разных типов морских образцов"</i>, — поделилась <b>Дарья Слонова</b>, соавтор работы, младший научный сотрудник в Лаборатории анализа метагеномов Сколтеха. <br>
<br>
Исследователи провели испытания восьми наборов для выделения ДНК. Для каждой комбинации набора и образца измеряли количество очищенной ДНК, степень её фрагментации, наличие загрязняющих веществ, ингибирующих ПЦР, примесь ДНК эукариот, альфа-разнообразие и воспроизводимость результирующего состава сообщества на основе секвенирования ампликонов 16S рРНК. Также учёные определили так называемые "китомы" (от англ. kit — набор) — состав микробных таксонов, которые могут присутствовать в самих реагентах, используемых для выделения ДНК. Это особенно важно, так как воды северных морей достаточно бедны микробами, и поэтому даже незначительная примесь контаминирующей ДНК может отразиться на анализе. <br>
<br>
<i>"В статье мы даём рекомендации учёным, какие методы лучше всего подходят, чтобы правильно выделить ДНК из морских образцов"</i>, — продолжила Алина Демкина. <i>"Исследователи смогут увидеть в статье, какие наборы подходят под каждый конкретный тип образца, в зависимости от целей их работы"</i>, — поддержала Дарья Слонова.<br>
<br>
Исследование поддержано грантом Министерства науки и высшего образования Российской Федерации № 075-10-2021-114 "Атлас микробных сообществ Российской Федерации" и грантом Российского научного фонда № 22-14-00004 "Поиск и характеристика новых систем бактериального иммунитета и вирусных анти-рестрикционных белков".
<p>
<b>Атлас микробных сообществ Российской Федерации</b> — большой проект Лаборатории анализа метагеномов Сколтеха и МГУ имени М. В. Ломоносова. Его цель — исследование многообразия микроорганизмов на территории России. Уникальность проекта в том, что в нём задействованы не только учёные, а широкий круг людей — школьники, студенты, волонтёры. Исследователи организуют экспедиции и собирают пробы грунта и воды в труднодоступных местах, выделяют метагеномную ДНК (ДНК всех микроорганизмов в пробах) и ищут новые антибиотики, вычленяя из метагеномов специальные биосинтетические кластеры.
</p>
Источник: <a target="_blank" href="https://new.skoltech.ru/news/new-research-unveils-how-obtain-high-quality-dna-marine-samples"><span style="color: #00aeef;">Сколтех</span></a>
</div>
<p>
</p>
«Покоряя Северный Морской Путь»
<p style="text-align: center;">
<img src="https://gumrf.ru/useruploads/images/News/2023/news_251223_1_1.jpeg" height="300" alt="">
</p>
<p>
В связи с завершением практики у обучающихся по специальностям членов экипажей морских судов, публикуем заключительный в этом году отзыв курсантов Стипендиальной группы СКФ, которые делятся впечатлениями от пройденной в компании плавательной практики.
</p>
<p>
Практика на судах – неотъемлемая часть обучения плавсостава. После окончания 4 курса нам, участникам Стипендиальной группы «Совкомфлот», предстояло пройти практику на судах компаний Группы компаний ПАО «Совкомфлот». После долгожданного звонка из кадрового офиса мы узнали, что распределены на флагман компании – арктический газовоз «Кристоф Де Маржери». В дальнейшем мы поняли, что практика на данном судне – это хорошая смесь крепких знаний, опыта, а также добрых и приятных воспоминаний, которые подарил нам экипаж данного судна во время морских переходов по Северному Морскому Пути (СМП).
</p>
<p style="text-align: center;">
<img src="https://gumrf.ru/useruploads/images/News/2023/news_251223_1_2.jpg" height="300" alt="">
</p>
<p>
Судно «Кристоф Де Маржери» является головным корпусом проекта Yamal LNG и имеет уникальный ледовый класс Arc7, что позволяет ему проходить даже толстые льды без ледокольной проводки. Благодаря усиленному ледовому корпусу газовоз успешно работает на СМП. Для обеспечения этой непростой работы на судне дополнительно имеется ледовый советник капитана. Эту должность занимают капитаны с большим опытом работы в арктических льдах и в сложных ледовых условиях. В их обязанности входит наблюдение за ледовой обстановкой по маршруту следования, прогнозирование погодных условий и дрейфа льда. Помимо этого, во время постановки на якорь, лоцманской проводки, швартовки ледовый советник оказывает помощь капитану судна своими ценными советами по проведению ключевых операций.
</p>
<p style="text-align: center;">
<img src="https://gumrf.ru/useruploads/images/News/2023/news_251223_1_3.jpeg" height="300" alt="">
</p>
<p>
Особенностью газовоза по сравнению с другими танкерами является наличие уникальных и разнообразных систем, разобраться в которых новичку совсем непросто. Все они обеспечивают перевозку специфического груза – сжиженного природного газа (СПГ). Для того, чтобы гарантировать постоянную безопасность грузовых операций и перевозку груза в безопасном состоянии во время рейса, необходимо разбираться в физических законах, в особенностях груза. За время нашей практики мы активно изучали системы судна, но нам еще предстоит многое освоить во время нашей следующей практики, так как полное понимание грузовых систем требует длительного изучения и большого практического опыта.
</p>
<p>
В самом начале практики капитан судна Чихиркин Владимир и старший помощник Красильников Никита обозначили наш будущий распорядок дня. Было решено, что для максимально эффективного знакомства с нашей будущей специальностью мы будем стоять ночные вахты, а днём работать на палубе, выполняя задания помощников. В свободное от работы и вахт время мы выполняли учебные задания от капитана и учебную программу практики, выданную университетом.
</p>
<p style="text-align: center;">
<img src="https://gumrf.ru/useruploads/images/News/2023/news_251223_1_4.jpg" height="300" alt="">
</p>
<p>
Кроме работы и учёбы было время и для отдыха. Его мы проводили за чаепитиями, походами в сауну и посиделками за настольными и компьютерными играми вместе с экипажем. Эти теплые моменты помогали снимать эмоциональную нагрузку, что очень важно, и давали силы на продолжение учебного процесса.
</p>
<p>
Во время практики нам посчастливилось застать два уникальных и разных экипажа данного судна. Каждый экипаж по-своему раскрыл для нас нашу будущую деятельность, познакомил с особенностями данного судна и профессии, по-доброму встретил нас, помог в обучении. Нам удалось посмотреть на выполнение обязанностей с разных точек зрения и почерпнуть от каждого экипажа что-то своё, вынести полезное, понять принципы решения тех или иных задач.
</p>
<p style="text-align: center;">
<img src="https://gumrf.ru/useruploads/images/News/2023/news_251223_1_5.jpeg" height="300" alt="">
</p>
<p>
Вместе со старшими помощниками Евсиковым Ильёй и Красильниковым Никитой мы изучали грузовые системы и принципы грузовых операций. Принимали непосредственное участие в погрузке и выгрузке судна. Каждый день мы могли наблюдать, как старшие помощники руководят палубными работами и отметили для себя, насколько важна кооперация боцмана и старшего помощника. Самое захватывающее для нас было изучение судна изнутри во время осмотров старшим помощником капитана коффердамов и балластных танков.
</p>
<p>
Вместе с членами экипажа мы изучали организацию пожарной безопасности судна и спасательные средства экипажа. По заданию ответственных помощников капитана мы проводили проверки и обслуживание огнетушителей, пожарных систем, средств индивидуальной и коллективной защиты, в том числе всего необходимого по Полярному Кодексу. Также мы помогали старпому заниматься распределением, хранением и заказом средств индивидуальной защиты.
</p>
<p>
С навигационными помощниками Корневой Евгенией и Хаменковым Игорем мы изучали оборудование мостика, проводили различные тестирования приборов, выполняли корректуру лоций и пособий, участвовали в составлении планов морских переходов судна. В обязанности второго помощника также входит судовая медицина, к которой на борту судна относится многое, и поэтому мы помогали проверять наличие, сроки годности и правильное расположение медикаментов.
</p>
<p>
Должностным обязанностям третьих помощников капитана мы уделяли особое внимание, так как скоро нам предстоит занять эту должность. Вместе с Воиновым Даниилом и Кравченко Андреем мы готовили документы для прихода в порт, на смену экипажа и подсчёт зарплат. Но нельзя не выделить особенную обязанность третьего помощника, связанную с судовым магазином, поскольку без него экипажу было бы сложно скрасить трудовые будни на судне. Помощники показали нам, как подсчитывать цены для этого магазина, следить за состоянием товара и грамотно вести учёт покупок экипажа.
</p>
<p style="text-align: center;">
<img src="https://gumrf.ru/useruploads/images/News/2023/news_251223_1_6.jpeg" height="300" alt="">
</p>
<p>
Отдельное спасибо хотелось бы сказать капитанам газовоза «Кристоф Де Маржери» Геню Сергею и Чихиркину Владимиру. Они определяли вектор обучения и нашего распорядка дня.
</p>
<p>
Вместе с ними мы изучали особенности строения газовозов, маневрирования и управления судном и много другое. Обсуждая с нами те или иные вопросы, Сергей Олегович и Владимир Сергеевич показывали нам, на что стоит обращать внимание, где можно посмотреть необходимую информацию, передавали свой опыт в решении различных задач. Вместе с ними и по их указанию мы научились определять высоту айсберга секстаном, изучали документы об остойчивости судна, изучали действия экипажа во время учебных тревог. Все время на судне Сергей Олегович и Владимир Сергеевич были для нас настоящими наставниками, ориентирами и курсоуказателями в нашей деятельности.
</p>
<p style="text-align: center;">
<img src="https://gumrf.ru/useruploads/images/News/2023/news_251223_1_7.jpeg" height="300" alt="">
</p>
<p>
Хотим выразить огромную благодарность компании ПАО «Совкомфлот» за организацию плавательной практики на таком современном судне, а также всем помощникам и капитанам, кто, не считаясь со временем, прикладывал свои силы для того, чтобы помочь нам разобраться в трудных вопросах практической подготовки, передать свой опыт и направить на истинный путь. С уверенностью можем сказать, что опыт, полученный на «Кристофе де Маржери», поможет нам стать востребованными специалистами и с лёгкостью выполнять трудные обязанности.
</p>
<p style="text-align: right;">
<strong>Курсанты 5 курса специальности 26.05.05 «Судовождение»</strong>
</p>
<p style="text-align: right;">
<strong>Гамбург Антон</strong>
</p>
<p style="text-align: right;">
<strong>Коротаев Александр</strong>
</p>
<p style="text-align: right;">
<strong><br>
</strong>
</p>
<p style="text-align: right;">
<strong>Департамент по конвенционной подготовке</strong>
</p>
<p>
</p>
<p>
<strong>Краткая справка</strong>
</p>
<p>
В рамках Соглашения о сотрудничестве между ГК ПАО «Совкомфлот» и ГУМРФ имени адмирала С.О. Макарова в университете реализуется стипендиальная программа СКФ. Сегодня в её состав входят 126 курсантов 2-5 курсов специальностей «Судовождение», «Эксплуатация судовых энергетических установок» и «Эксплуатация судового электрооборудования и средств автоматики». Ежегодно Компания проводит отбор наиболее успевающих обучающихся. Курсанты, прошедшие отбор в Стипендиальную группу СКФ и соответствующие всем требованиям к нахождению в ней, обеспечены дополнительной стипендией ГК ПАО «Совкомфлот», плавательной практикой на судах СКФ в соответствии с графиками учебного процесса и правом гарантированного трудоустройства в Компанию после выпуска из университета.
</p>
Арктика нуждается в людях. В САФУ обсудили, кого не хватает в Арктике.
<div>
14-15 декабря в Архангельске состоялась Всероссийская научная конференция "Арктика — национальный мегапроект: кадровое обеспечение и научное сопровождение". Конференция проводилась Ассоциацией "Национальный арктический научно-образовательный консорциум" и САФУ имени М. В. Ломоносова совместно с XI международным форумом "Арктические проекты — сегодня завтра". Первая секция конференции была посвящена кадровому обеспечению экономики регионов Арктической зоны РФ.<br>
<br>
Член Комитета Совета Федерации по федеративному устройству, региональной политике, местному самоуправлению и делам Севера <b>Денис Гусев</b> открыл разговор о привлечении молодых специалистов в регионы Арктической зоны Российской Федерации. Он рассказал, что растущие инвестиционные проекты в Арктике требуют значительного привлечения трудовых ресурсов, решить задачу за счёт населения арктической зоны невозможно, требуется привлечение молодых специалистов из других регионов.<br>
<br>
<i>"Эффективный механизм — целевое обучение"</i>, — продолжал Денис Владимирович, — <i>"важно обеспечить участие работодателя в разработке новых методик, определении уровня профессиональных знаний и умений, это будет способствовать более качественной подготовке кадров, соответствию профилей подготовки потребностям рынков труда, которому сейчас нужны геологи, гидрологи, океанологи, мерзлотоведы. Эффективна практика обучения по двум профилям, один из которых — арктический. Необходимо внедрение практикоориентированных моделей обучения для закрепления специалистов в Арктических регионах. Главное подготовить специалистов базового уровня".</i><br>
<br>
Разговор об эффективных кадровых стратегиях продолжил директор Института стратегического развития Арктики САФУ <b>Александр Сабуров</b>. Он представил результаты двухлетнего исследования, посвящённому кадровому обеспечению предприятий судостроительной, лесной и рыбопромышленной отраслей.<br>
<br>
<i>"Кадровый дефицит испытывают все три отрасли. Все больше работодателей стали понимать, что о кадрах нужно думать на перспективу, важно взаимодействие с образовательными учреждениями. Тренд последних лет со стороны крупных предприятий — комплексные проекты сотрудничества с университетами и колледжами, это и практика, и стипендия, и темы дипломных работ, обучение сотрудников, вложения в материально-техническую базу. Наиболее эффективные формы взаимодействия связаны с вовлечением студентов в производственную деятельность, и непосредственное участие работодателя в образовательной деятельности".</i><br>
<br>
В докладе говорилось, что в наибольший спрос наблюдается на специалистов технического профиля со средним профессиональным образованием. В судостроительной отрасли повышен спрос на сборщиков корпусов, электромонтажников, трубопроводчиков. В рыбопромышленной отрасли — на специалистов по судоремонту, в лесной — на машинистов, слесарей-ремонтников, инженеров. <br>
<br>
Но из-за дисбаланса на рынке заработных плат нередко выпускники по данным специальностям выбирают работу в больших городах, получая аналогичную или большую зарплату условным курьером или офисным работником они трудятся в более комфортных условиях и несут меньше ответственности. Поэтому, помимо обеспечения конкурентоспособных заработных плат важно повышать престиж профессий, давать ощущение причастности к чему-то важному, возможности карьерного роста, а также делать комфортным проживание в Арктических городах.<br>
<br>
С этим напрямую связана важность подготовки и специалистов креативных индустрий, чему был посвящён доклад младшего научного сотрудника ГАУ ЯНАО "Научный центр изучения Арктики" <b>Екатерины Суховой</b>. Екатерина Александровна рассказала, как важны для Арктических городов талантливые дизайнеры и стилисты, создающие одежду с арктической эстетикой, шеф-повара, создающие блюда с использованием местных экзотических ингредиентов, эксперты по погружению в культуру коренных народов, фотографы, изготовители сувениров по древним традициям.<br>
<br>
Часть сессии была посвящена работе со школьниками, ведь ориентация на Арктику должна вестись с самого младшего возраста. Участники сессии подчеркнули, что необходимо давать детям достоверные источники информации о востребованности профессии, заработной плате, социальных гарантиях. Об одной из форм таких мероприятий рассказала сотрудники Петрозаводского государственного университета <b>Анна Симакова</b> и <b>Евгения Хотеева</b>. Они проводили интенсив "Билет в Арктику", который охватил 20 тысяч детей из 19 регионов страны и 85 школ.<br>
<br>
В обсуждении активно участвовали работодатели из всех регионов Арктической зоны РФ. Они призвали государство законодательно и финансово содействовать предприятиям в профориентационной работе и сотрудничестве с учебными заведениями.<br>
<br>
Источник: <a target="_blank" href="https://narfu.ru/life/news/university/385808/"><span style="color: #00aeef;">Пресс-служба САФУ имени М.В. Ломоносова</span></a><br>
</div>